פחות משבוע אחרי שצורף כחבר למועצת חכמי התורה של ש"ס, ובזמן שהוא אף מוצג בתקשורת החרדית כאחד מבכיריה – הראשון לציון הרב יצחק יוסף ביקר בחריפות את הממשלה על כך שלא גיבשה עדיין חוק פטור מגיוס, שיסדיר את מעמדם של תלמידי הישיבות החרדיות כפטורים משירות צבאי.
בשיעורו השבועי אמר הרב הראשי לשעבר: "אנחנו נמצאים במצב מאוד לא פשוט, אם היו עושים את זה לפני שנתיים, כשקמה הממשלה, לא היו מושכים את זה – הכול היה בסדר, היה חוק גיוס והכול היה בסדר. לצערנו הרב משכו ומשכו את זה, וזה גורם עכשיו לבעיות. אין תקציבים לעולם הישיבות, עולם הישיבות סובל מחוסר תקציב, לא יכולים להרחיב גבולם בתלמידים, מצרים את צעדיהם".
הרב יוסף הביע חשש כי במצב של גיוס נרחב מהחברה החרדית, בחורי הישיבות הספרדים יהיו הראשונים שיגויסו. לדבריו "ספרדים יכולים חס ושלום... הם לא כל כך... האשכנזים יותר חזקים, תיקח מישהו ממאה שערים לצבא? בשום פנים הוא לא יסכים. דיברתי על זה עם ועד הישיבות, הם עושים מה שהם יכולים לעשות".
בהמשך סיפר הרב על מפגשיו עם חיילי צה"ל בשנה החולפת, בתפקידו כרב הראשי לישראל: "משמחת תורה בשנה שעברה ביקרתי בהרבה בסיסים, אני חושב שאין בסיס בארץ שלא ביקרתי בו, זה זמן לחזק את החיילים. הייתי בחיל האוויר, בחיל הים, למעלה ולמטה, בחיל המודיעין, ראיתי את מסירות הנפש של החיילים. אמרתי איתם 'שמע ישראל', חיילים לא דתיים לוקחים טישו ומניחים על הראש וזועקים 'שמע ישראל'".
בשבוע שעבר הפך הרב יצחק יוסף לחבר במועצת חכמי התורה – ההנהגה הרוחנית של תנועת ש"ס. חלק מהגורמים במפלגה ראו בו ממשיך טבעי לאביו הרב עובדיה יוסף, שאחרי כהונתו כרב הראשי לישראל ייסד את המועצה והיה המנהיג הרוחני של התנועה. בש"ס בשלב זה עוד לא החליטו אם הרב יוסף הבן הוא המתאים להנהיג את התנועה מבחינה רבנית, ולכן הוא צורף כחבר בלבד, אך כשהבולטות שלו ברורה. המפגש של חברי המועצה נערך בביתו, כשיו"ר המפלגה אריה דרעי יושב לצידו.