במשרד ראש הממשלה בנימין נתניהו התייחסו לחקירת ראש המל"ל צחי הנגבי בחשד לקבלת שוחד, ומסרו כי "מדובר בחקירה שאינה קשורה למשרד ראש הממשלה ולמטה לביטחון לאומי, על אירוע מלפני שבע שנים". מטעמו של הנגבי נמסר כי "מדובר על טענה שהועלתה במסגרת סכסוך אזרחי בין אנשי עסקים ופורסמה כבר לפני שנתיים. ראש המל"ל כבר הכחיש טענות אלה מיד עם פרסומן ומסר גרסתו זו גם למשטרה".