ראש הממשלה בנימין נתניהו התייחס לפרשת הצוללות במהלך דיון מיוחד שהתכנס לבקשת 40 חברי קואליציה בשל "הכישלון בביטחון ובכלכלה" במליאת הכנסת, ואמר: "ההחלטות שקיבלתי היו חיוניות עבור ביטחון ישראל. הספינות שהבאנו יירטו מתקפות כטב"מים על ישראל במלחמה הנוכחית והצילו חיים רבים. מה היה קורה אם לא הייתי מקבל את ההחלטה הזו?". הוא הוסיף: "אתם מדברים איתי על נוהלים בירוקרטיים, אני מדבר על ביטחון ישראל".