ועדת החקירה הממלכתית בפרשת הצוללות שלחה מכתבי אזהרה לחמישה גורמים "העלולים להיפגע מהחקירה". מכתבי אזהרה נשלחו לראש הממשלה בנימין נתניהו, לשר הביטחון לשעבר משה (בוגי) יעלון, לראש המל"ל בשנים הרלוונטיות יוסי כהן, לרם רוטברג, מפקד חיל הים בשנים 2016-2011 ולאבנר שמחוני, עובד המל"ל בשנים 2016-2010. נכתב כי "המוזהרים התבקשו להודיע לוועדה תוך 30 יום אם בכוונתם למנות עורך דין שייצגם בפני הוועדה".