השר לביטחון לאומי איתמר בן גביר התייחס בצהריים (רביעי) לפינוי הכרם בבנימין שאירע הבוקר, ואמר כי "לא לנער הזה פיללנו. הצטרפנו לממשלה על בסיס הבטחה של ראש הממשלה שזו תהיה ממשלת ימין מלא מלא. ממשלה כזו לא אמורה לא לפנות את חאן אל אחמר בגלל שיקולים מדיניים או לא לגעת בבניינים במזרח ירושלים. ממשלת ימין מלא מלא לא יכולה להיות ממשלה שגיבורה רק על יהודים".
דברי השר לביטחון לאומי הגיעו אחרי שמוקדם יותר שוחחו ראש הממשלה בנימין נתניהו והשר בצלאל סמוטריץ' בנוגע להעברת הסמכויות במשרד הביטחון לידי סמוטריץ', המכהן כשר במשרד הביטחון. בהסכם הקואליציוני נקבע כי הסמכויות על מתאם פעולות הממשלה בשטחים והמנהל האזרחי יועברו לידי סמוטריץ', אך בשיחה לא נרשמה פריצת דרך ועדיין קיימת מחלוקת בין שר הביטחון יואב גלנט לשר סמוטריץ'.
סמוטריץ' תקף את גלנט בחריפות בעקבות פינוי הכרם, ואמר כי "אם יש לגלנט בעיה, הוא מוזמן לשים את המפתחות. אני משוכנע שרבים בליכוד ישמחו למלא את מקומו במשרד הביטחון". נתניהו, מצידו, הורה לעצור זמנית את פינוי הכרם כמעט בסופו של האירוע, אך פעילים בשטח כינו את ההוראה "תעלול יחצ"ני".
עם זאת, גורמים בממשלה ציינו כי "בניגוד לסיבוב הקודם בין גלנט לסמוטריץ', הפעם מדובר בפינוי שעליו ידעו כולם - כל הגורמים הפוליטיים, הצבאיים והמדיניים - במשך זמן רב, לפחות כמה שבועות. הם עושים סיבוב פוליטי. סמוטריץ' מבקש לנגח את גלנט במסגרת קרב הסמכויות ועושה זאת על חשבון פינוי הכרם, שהיה ידוע לו זמן רב מראש".
בהתאם, גורמי ביטחון התייחסו לפינוי הכרם ואמרו כי "בעל הקרקע קיבל הארכה ואף התחייב בפני בג"ץ שיתפנה באופן עצמאי. בנוסף הציעו לו קרקע חלופית הוא סירב. ואמרו לו במפורש שאם לא יפנה הוא יישא בעלויות. הוא התחייב וחתם שיפנה".
עשרות צעירים מישיבות תיכוניות ומאולפנות הגיעו לכרם במטרה למנוע את פינויו, ואחד מהם אף טיפס לראש עץ ברוש והתבצר שם. הצעיר, עמישב מלט, תקף בריאיון לאולפן ynet את ראשי מפלגות הימין החברות בקואליציה, וציין כי הוא "לא רואה אותם, וזו חרפה".
עם זאת, ח"כ לימור סון הר-מלך (עוצמה יהודית) הגיעה למקום בניסיון למנוע את פינוי הכרם, ותועדה כשהיא ניצבת מול דחפור בניסיון לחסום את התקדמותו. בהמשך תועדו כמה מהשוטרים בשטח כשהם מקיפים את חברת הכנסת כדי למנוע ממנה לסכל את פינוי הכרם. מאוחר יותר אמרה הר-מלך כי אחד השוטרים פגע בה מינית: "הוא פשוט עשה משהו שאסור היה לעשות. אני צריכה עוד לעכל את מה שהיה שם כדי שאוכל להגיב על זה בצורה יותר ברורה".
מהמשטרה נמסר בתגובה לדבריה של ח"כ הר-מלך כי "לצד החסינות וחופש התנועה שיש לחברת הכנסת, הלוחמים פעלו ברגישות רבה ונחישות תוך הכלה וניהול שיח מכבד וטיפול מקצועי לאורך כל האירוע. נמשיך לפעול ברגישות ונחישות בכל משימה ובכל מקום".