הפלסטינים הכריזו על "יום זעם" בירושלים, אבל מוקדי העימותים במהלך הבוקר והצהריים היו דווקא בג'נין ובחווארה. תפילות יום השישי בהר הבית הסתיימו ללא אירועים חריגים, וגם הנוכחות בהן הייתה יחסית דלה.
מחסום שועפט, מוקד מתיחות בימים האחרונים בעקבות הפיגוע בשבת האחרונה שבו נורתה למוות הלוחמת נועה לזר והסגר שהוטל על מחנה הפליטים אחריו כחלק מהמצוד אחר המחבל, היה פתוח הבוקר. כלי רכב נכנסו ויצאו ממחנה הפליטים, וכוח המשטרה שהיה במקום נשאר ללא תעסוקה.
אבל בגזרות אחרות לא היה שקט. באזור המאחז אביתר כ-30 פלסטינים יידו אבנים לעבר כוחות הביטחון. הפרות סדר אירעו גם באזור צומת הביתות, ליד חווארה, לאחר שתועד נזק לחנויות פלסטיניות בכפר שמדרום לשכם. בסהר האדום אמרו כי שלושה פלסטינים נפצעו, אחד מהם מירי חי, במהלך עימותים עם הכוחות ועם מתנחלים בחווארה. צעירים יהודים רעולי פנים תועדו שם משליכים אבנים לעבר בית של פלסטינים. בהמשך דווח כי גם ילדה יהודייה בת שלוש נפצעה קל מיידוי אבנים של מתפרעים פלסטינים, עת נסעה ברכב עם בני משפחתה. בתמונה שהופצה נראתה הילדה מדממת מהשפתיים שלה.
העימותים המרכזיים התנהלו הבוקר במחנה הפליטים ג'נין, לשם נכנסו כוחות הביטחון ועצרו פעיל חמאס שהיה מעורב בפיגועי ירי. מחבל שפתח בירי לעבר הכוחות נהרג ובהמשך נמסר כי גם ד"ר עבדאללה אבו תין, מנכ"ל מחלקת הרישוי במשרד הבריאות הפלסטיני, נורה למוות. לפי דיווח פלסטיני, הרופא נפגע מירי צלף של צה"ל בעת שהיה בחצר בית החולים.
בצה"ל מתחקרים את האירוע, ועדיין לא ברור אם הרופא נפגע מאש המחבלים או הלוחמים. עם זאת, בצבא חושדים שהרופא היה בעצמו מעורב בירי על הכוחות. החשד הזה גבר לאחר שמזכיר תנועת פתח בג'נין, עטא אבו רמילה, אמר כי "הרופא, חבר התנועה, נהרג בעת שנלחם כתף אל כתף עם לוחמי ההתנגדות". לאחר שנקבע מותו, כרזות של פתח היללו את הרופא וגם בהן צוין כי הוא פעיל בתנועה.
בעבר תועד הרופא נושא נשק, לצד חמושים. גורמי ביטחון ציינו בנוסף כי בעמוד הפייסבוק שלו דברי הסתה רבים ואמרו כי הצוות הרפואי שמצא את אבו תין בשטח מסר שהוא אותר רעול פנים ועם נשק. צה"ל ביקש להדגיש בהודעה שפרסם כי "שהות אזרחים בלתי מעורבים במרחב לחימה מהווה סכנת חיים ממשית".