הנחת העבודה במערכת הביטחון היא שששת האסירים הביטחוניים שנמלטו הלילה (בין ראשון לשני) מכלא גלבוע בעמק חרוד בצפון הארץ, חצו את קו התפר לשטחי יהודה ושומרון ומקבלים סיוע שהוכן מראש.
מתוך חשיבה מכוונת, כרגע לא מתבצעות בשטח פעילות של הצבת מחסומים ועליות לבתים של קרובי ששת המחבלים. הסיבה: הרצון להשיג קצה חוט מטעות שיעשו האסירים הנמלטים במהלך מנוסתם.
המצוד מתמקד בעיקר במישור המודיעיני בהובלת שירות הביטחון הכללי. במקביל, לוחמים מיחידות מובחרות בצה"ל הוקפצו לגזרת ג'נין. עם זאת, תגבורי סדרי הכוחות למרחב הם נכון לעכשיו פנים אוגדתיות, כלומר בהיקפים מצומצמים.
הבריחה מהכלא המאובטח התקבלה במערכת הביטחון בהפתעה וכמקרה חסר תקדים של אירוע מאורגן ומתוכנן, רב משתתפים, שלא צף מודיעינית באופן שיוביל לסיכולו.
שר הביטחון בני גנץ קיים שיחת חיתוך מצב עם ראש שירות הביטחון הכללי נדב ארגמן, ראש אגף המבצעים אלוף עודד בדיוק ומפקד פיקוד מרכז אלוף יהודה פוקס.
מלשכת גנץ נמסר כי "שר הביטחון התעדכן במאמצים המודיעיניים והמבצעיים, והנחה על תגבור הכוחות במעברי הגבול והתפר, תוך מוכנות מבצעית לביצוע כל הפעולות הנדרשות לתפיסת המחבלים בשיתוף פעולה מלא עם שירות הביטחון הכללי וכלל גופי הביטחון. בהמשך היום תתקיים הערכת מצב נוספת".
ראש הממשלה נפתלי בנט שוחח עם השר לביטחון הפנים עמר בר-לב. בנט הדגיש כי מדובר באירוע חמור שמחייב מאמץ כלל מערכתי של כוחות הביטחון. מלשכתו של בנט נמסר עוד כי "ראש הממשלה מקבל עדכונים שוטפים על אודות מאמצי החיפוש אחר המחבלים, ויקיים התייעצויות בהמשך בהתאם לצורך".
במהלך ביקור הבוקר במוצב צופים בשומרון לרגל השנה החדשה, אמר ראש הממשלה בנט לחיילים: "עליכם להיות דרוכים במיוחד עד ללכידת המחבלים".
מתחקור ראשוני עולה כי בשעה 03:00 לפנות בוקר דיווחו אזרחים למשטרה על זיהוי דמויות חשודות בסמוך לכלא. כוחות מיוחדים של שירות בתי הסוהר בתגבור יחידות מצדה ויחידות משטרה יחד עם לוחמי צה"ל, משמר הגבול, גששים ושירות הביטחון הכללי פתחו מיד בחיפושים אחר האסירים שנמלטו.
בשחזור הראשוני נקבע כי האירוע החל בסמוך לשעה 01:30 - אז נמלטו ששת האסירים באמצעות פתח שהתגלה בתאם לכיוון האזור הדרומי של כלא גלבוע. עם השישה נמנה המחבל איש פתח זכריא זביידי, שהיה מעורב בפעולות טרור רבות שבהן נרצחו ונפצעו ישראלים רבים. שאר הנמלטים משתייכים לג'יהאד האיסלאמי.