פיקוד העורף התריע הלילה (בין שישי לשבת) על חשש לחדירת מחבלים להתנחלות מבוא חורון בבנימין. כשלוש שעות לאחר פרסום ההתרעה, הוסר החשש ופיקוד העורף הודיע על חזרה לשגרה. "היכנסו מיד למבנה, נעלו את הדלתות וסגרו את החלונות. התנועה באזור אסורה וחל איסור להיכנס אליו עד להודעה חדשה", נמסר בהנחיה לתושבים.
ביום חמישי המחבל אחמד יאסין גידאן (19), תושב קיביה שבבנימין, ירה למוות בלוחם סיירת גבעתי סמ"ר שילה יוסף אמיר (22) סמוך לקדומים. הפיגוע התרחש בכביש 55, בין שכונת מצפה ישי בקדומים לצומת ג'ית. מדובר על ציר שמחבר את קדומים לשכם, אזור שבו היו פיגועים רבים בעבר.
הפיגוע התרחש מעט לפני 15:45, בזמן שאוגדת איו"ש תחת "בט"ש מוגבר" בכל הגזרות עם כוננות גבוהה. רכב המחבל זוהה בצירים העוקפים של היישוב קדומים, ובזמן הפיגוע הופעלה אזעקה ביישוב קדומים מחשש לחדירת מחבלים.
סייר אזרחי הוקפץ למקום אחרי שבצבא חשדו ברכב. הוא בדק את הנהג ואת תעודות הזהות שלו ולאחר מכן הצטרף אליו סיור צבאי. אז פתח המחבל באש לעבר הלוחם שנהרג.
מיד לאחר מכן החל המחבל לרוץ - ויתר הלוחמים ירו לעברו ופגעו בו. האירוע נמשך שניות בלבד. כוח ביטחון אזרחי מכיתת הכוננות קפץ למקום - וסייע בחיסול המחבל.
הזרוע הצבאית של חמאס, גדודי עז א-דין אל-קסאם, קיבלה אחריות על הפיגוע באופן רשמי. "באנו לומר לשר הציוני סמוטריץ' שאל-קסאם כמעט דפק בדלת הבית שלך", נכתב בהודעה לאחר הפיגוע.