מחבלים המזוהים עם הג'יהאד האיסלאמי, שפועלים במחנה הפליטים בלאטה שממזרח לשכם, מסרו את נשקיהם והסגירו את עצמם למנגנוני הרשות הפלסטינית מחשש למבצע של צה"ל. כך אמר ל-ynet בצהריים (חמישי) גורם במנגנונים. "על החמושים מופעל לחץ ציבורי גדול לאור המראות במבצע הצבאי. מאתמול הם החלו ליצור קשר - והחלו להיכנע", הוסיף הגורם, שציין כי מספרם, להערכתו, עומד על כ-15.
המבצע הצבאי של צה"ל בשומרון נמשך בג'נין ובטול כרם, ובצהריים אמרו בצבא כי אחת מהמטרות המרכזיות שלו היא סוגיית המטענים. בצבא ציינו כי אותרו מטענים עוצמתיים שגם מזכירים את המטען ששימש את המחבל בפיגוע בתל אביב.
במקביל, כוחות צה"ל ושב"כ השלימו את המבצע שניהלו במחנה פרעה בבקעה. המבצע ארך כ-30 שעות, ונועד לחסל מחבלים ולחשוף תשתיות טרור במחנה. כוחות צנחנים הגיעו למקום במסוקי חיל האוויר וכיתרו את המחנה, ובזמן המבצע הותקף מהאוויר רכב עם מחבלים.
בעיצומו של המבצע, לוחמי דובדבן בהכוונת שב״כ איתרו באמצעות רחפן מעבדת מטענים וחמ״ל מבצעים, הממוקמים בתוך מסגד במחנה. במסגד נמצאו מטענים מוכנים לשימוש שיועדו נגד כוחות הביטחון, לצד אמצעי לחימה רבים.
ביממה הראשונה של המבצע בשומרון ובבקעה חוסלו לפחות 12 מחבלים, נעצרו יותר מ-10 מבוקשים והושמדו עשרות מטענים לצד אמצעי לחימה. בין המחבלים המחוסלים גם מוחמד ג'אבר, שכונה "אבו שג'אע" והיה "ראש התארגנות הטרור במחנה נור א-שמס". במהלך המבצע נפצע באורח בינוני לוחם צה"ל ולוחם ימ"מ נפצע באורח קל.
"אבו שג'אע" היה מעורב בפיגועים רבים וגם בהכוונת הפיגוע בחודש יוני האחרון, שבו נרצח אמנון מוכתר (67) בסוף חודש יוני בקלקיליה. כראש התארגנות הטרור במחנה הפליטים, הוא פיקד על כ-30 מחבלים. אמש סמוך לשעה 21:00 הגיע כוח לעצור אותו בנור א-שמס, אך ברגע האחרון הפעולה בוטלה לאחר שהתברר כי הוא לא נמצא באותו יעד.
סמוך ל-03:00 בלילה התקבל מודיעין חדש על מיקומו של ג'אבר, במבנה ליד מסגד, והכוחות ביצעו במקום נוהל "סיר לחץ", לאחר שהמחבל סירב להסגיר את עצמו וירה על הכוחות. במסגרת הפעילות נורו טילי כתף אל המבנה שבו הסתתר ג'אבר, ולבסוף הוא נורה למוות על-ידי הלוחמים כאשר ניסה לרוץ ולברוח מהמקום. שני מחבלים נוספים שהיו בקרבת מקום חוסלו במקביל, ו"סגנו" הסגיר את עצמו לאחר מכן לחקירה.