תחקיר הפיגוע שהתרחש בצהריים (רביעי) סמוך לקדומים העלה כי המחבל שרצח ישראלי הגיע לבד, ניסה להיכנס ליישוב - ומצא ששעריו סגורים. המחבל הוא אחמד יאסין גידאן, בן 19 מקיביה שבבנימין. בשב"כ אמרו כי לא היה לו רקע ביטחוני קודם. גידאן הוא בן דודו של מועתז חואג'ה, שביצע את הפיגוע ברחוב דיזנגוף בתל אביב בחודש מרץ. דודו של המחבל, סולימאן גיידאן, ביצע פיגוע התאבדות באזור בית אל בשנת 1993.
הזרוע הצבאית של חמאס, גדודי עז א-דין אל-קסאם, לקחה אחריות על הפיגוע באופן רשמי. בהודעת נטילת האחריות לפיגוע, נכתב "באנו לומר לשר הציוני סמוטריץ', שאל-קסאם כמעט דפק בדלת הבית שלך".
הפיגוע התרחש מעט לפני 15:45, בזמן שאוגדת איו"ש תחת "בט"ש מוגבר" בכל הגזרות עם כוננות גבוהה. רכב המחבל זוהה בצירים העוקפים של היישוב קדומים, ובזמן הפיגוע הופעלה אזעקה ביישוב קדומים מחשש לחדירת מחבלים.
סייר אזרחי הוקפץ למקום אחרי שבצבא חשדו ברכב. הוא בדק את הנהג ואת תעודות הזהות שלו ולאחר מכן הצטרף אליו סיור צבאי. אז פתח המחבל באש לעבר הישראלי שנהרג. בתמונות שהגיעו לידי ynet נראים הקליעים בשכפ"ץ שלבש הסייר.
מיד לאחר מכן החל המחבל לרוץ - ויתר הלוחמים ירו לעברו ופגעו בו. האירוע נמשך שניות בלבד. כוח ביטחון אזרחי מכיתת הכוננות קפץ למקום - וסייע בחיסול המחבל.
מותו של הישראלי שנפגע מירי המחבל נקבע במקום. חובשים ופרמדיקים של מד"א שהגיעו למקום טיפלו בו יחד עם כוחות רפואה של צה"ל. מצבו של הישראלי שנפגע הוגדר תחילה קשה, אך הידרדר בשטח ולבסוף נאלצו הצוותים לקבוע את מותו.
הפיגוע התרחש בכביש 55, בין שכונת מצפה ישי בקדומים לצומת ג'ית. מדובר על ציר שמחבר את קדומים לשכם, אזור שבו היו פיגועים רבים בעבר.
ראש מועצת שומרון, יוסי דגן, שוחח עם מח"ט שומרון אל"מ שמעון סיסו וקיבל עדכונים מגורמי הביטחון על הפיגוע: "פיגוע הירי הזה ממחיש שארגוני הטרור מנסים אותנו שוב ושוב ושוב, גם אחרי המבצע בצפון השומרון. אזרחי ישראל וכמובן תושבי השומרון - מחזקים ברגעים אלו את חיילי צה"ל וכוחות הביטחון ודורשים מהממשלה לתת תשובת מחץ לטרור הזה כמו לכל הטרור של הרשות הפלסטינית".
דגן הוסיף: "אנחנו צריכים להבהיר להם שאנחנו לא נשברים, אנחנו כאן, לעולם לא נישבר. הממשלה חייבת לשחרר לצה"ל את הכבלים ולתת לצה"ל לפעול בכל מרחב יהודה ושומרון בכל הכוח, כדי לגדוע את גל הטרור ולהביא ביטחון לכל מדינת ישראל".
ראש מועצת קדומים, חננאל דורני, שהגיע לזירת הפיגוע, אמר: "הפעילות בג'נין הייתה מאוד חשובה כדי לגדוע את קיני הטרור וכדי לא לאפשר להם את הקלות לצאת ולפגע בנו. הפעילות הזו חשובה וצריכה להתבצע עוד בג'נין, בשכם ובמקומות נוספים. בנוסף, אנחנו קוראים לצבא להחזיר את המחסומים ביציאות מהערים הגדולות וריכוזי הכפרים הערביים על מנת שמי שמגיע לצירים המשותפים נדע שעבר בקרה ובכך הסיכוי שהוא מחזיק נשק ירד. אני מחזק את צה"ל, את כוחות הביטחון והסיירים שלנו ושולח את תנחומינו למשפחת ההרוג".
מדובר בפיגוע נוסף בשורה של פיגועים בימים האחרונים. אתמול בצהריים מחבל ירה לעבר בית עסק וניידת משטרה בשכונת השומרונים בהר גריזים שבשומרון. לא היו נפגעים, אך נזק קל נגרם למבנה ולרכב. כוחות צה"ל פתחו בסריקות אחר חשודים. הירי התרחש שעות לאחר שכוחות צה"ל השלימו את יציאתם ממחנה הפליטים ג'נין, והביאו לסיומו של מבצע "בית וגן" במקום.
שלשום, בזמן המבצע, התרחש פיגוע דריסה ודקירה בתל אביב. מחבל פלסטיני עלה על המדרכה ועל שביל האופניים ברחוב פנחס רוזן בתל אביב - כשהוא נוסע נגד כיוון התנועה ודורס עוברי אורח. המחבל יצא בשלב מסוים מהרכב והחל לדקור אנשים - ואז נורה וחוסל. תשעת הפצועים בפיגוע פונו לבתי החולים איכילוב, בילינסון ומאיר. מצבם של ארבעה הוגדר קשה - בהם אישה שהייתה בהיריון ואיבדה את עוברה עקב הפציעה.
ביום שני נער פלסטיני בן 16 פצע צעיר באורח קל בפיגוע דקירה בבני ברק. הנער נמלט אחרי הדקירה, אבל נתפס על ידי אופנוענים של המשטרה, והועבר לחקירה. במשטרה הודיעו תחילה כי נבדק חשד למניע לאומני. בהמשך הערב, בהצהרה שמסר המפכ"ל יעקב שבתאי, הוא כבר כינה אותו "מחבל" בצורה חד-משמעית. הנער, תושב הכפר הפלסטיני פחמה שבאזור ג'נין, אמר לאחר שנתפס כי ביצע את הפיגוע בגלל המבצע הנרחב שבו פתח צה"ל במחנה הפליטים. בהמשך הודיעה המשטרה כי בני משפחתו, אביו (53) ואחיו (31), נעצרו בבית המשפחה בפחמה.