הרמטכ"ל רב-אלוף הרצי הלוי פרסם את מסקנות התחקיר על הקרב בבארי ב-7 באוקטובר: "צה"ל לא עמד במשימת ההגנה על התושבים במובן הקשה ביותר וכשל במשימתו; לחימת התושבים וחברי כיתות הכוננות בלמה את כיבוש הקיבוץ; לצד מעשי גבורה של הלוחמים, בוצעו שגיאות חמורות; מהצהריים היו כוחות מחוץ לקיבוץ, בעוד בתוכו מסע ההרג נמשך - מצב חמור שאסור שיקרה; בחלק מהמקרים כוחות לחמו להגנת מוצב ולפינוי וטיפול בחיילים פצועים - לפני שעשו זאת עבור האזרחים". הרמטכ"ל סיכם כי התחקיר הינו הראשון בתחקור הפנימי שנערך בצה"ל. בסופו, יתקבלו החלטות וייגזרו משמעויות מלבד המסקנות המבצעיות.