לאחר כ-60 שעות, כוחות הביטחון השלימו הערב (יום חמישי) מבצע נרחב ומשמעותי לסיכול טרור במחנה הפליטים ובעיר ג'נין - הגדול ביותר בעיר זה יותר מ-20 שנה.
במסגרת המבצע, שנערך בפיקודה של חטיבת מנשה, הכוחות סרקו מאות מבנים, החרימו מאות מטענים ויותר מ-50 כלי נשק מסוגים שונים, ועיכבו לתחקור כ-300 חשודים, שמתוכם נעצרו עד כה כ-60 מבוקשים.
הפעילות בג'נין החלה ביום שלישי לפנות בוקר, והסתיימה כאמור רק בשעות האחרונות. רוב הלוחמים שפעלו במבצע, ולמעשה נמצאים בגזרה עוד מה-7 באוקטובר, הם לוחמי המילואים של חיל ההנדסה הקרבית. במהלך המבצע הלוחמים איתרו יותר מ-10 פירים תת-קרקעיים, שבע מעבדות להכנת מטעני חבלה וחמישה חמ"לי תצפיות שנועדו למעקב אחר הכוחות. חלק מתשתיות הטרור שנמצאו הושמדו על ידי הלוחמים, בהן דירת מטענים בלב המחנה שאותה פיצצו לוחמי ההנדסה.
במהלך המבצע כלי טיס של חיל האוויר תקף שתי חוליות מחבלים שהשליכו מטענים וירו לעבר הכוחות. כלי הטיס חיסלו שבעה מחבלים ופצעו נוספים. יותר מ-10 מחבלים חוסלו במהלך המבצע, בעוד ששבעה לוחמי צה"ל וקצין נפצעו באורח קל, טופלו בשטח ופונו להמשך קבלת טיפול רפואי בבית חולים.
מדובר במבצע הגדול ביותר של צה"ל במחנה הפליטים ג'נין מאז מבצע חומת מגן, גם בהיקף הכוחות, שמנו כ-1,400 לוחמים, וגם באורכו - יותר מ-60 שעות. חרף ההתנגדות שבה נתקלו הכוחות, הפעילות במחנה עברה בשקט יחסי, למעט כמה תקריות חילופי אש מעטות, לעומת הקיץ האחרון, כאשר נתקלו כוחות צה"ל בהתנגדות משמעותית של ירי ומטעני צד שהוטמנו בצירי התנועה, וכל כניסה למחנה הפליטים הייתה מלווה בכוחות רבים ואש כבדה.
המחבלים שנעצרו הועברו להמשך חקירת כוחות הביטחון. כאמור, במבצע אותרו תחמושת רבה, חומרים להכנת מטענים, ציוד צבאי וחלקי כלי נשק רבים, בנוסף לכספי טרור בסך של יותר מ-100,000 שקלים.
במבצע השתתף גם מפקד אוגדת איו"ש תא"ל אבי בלוט, שאף נכח עם הלוחמים בפעילות. תא"ל בלוט צפוי לסיים את תפקידו בשבוע הבא אחרי שנתיים ושלושה חודשים בתפקיד, שבמהלכן עבר קדנציה מורכבת, עם רצף פיגועים באזור. בלוט נחשב למפקד התקפי מאוד, שהציב כמטרה את חיסול "ערי המקלט" ביהודה ושומרון.
יחד עם פיקוד המרכז, בלוט הוביל את מבצע "שובר גלים" שהחל לאחר רצף הפיגועים הקטלני בלב הארץ, ובמהלכו הודק קו התפר בצורה משמעותית ובוצעו עשרות מעצרים וסיכולים. בלוט מוערך מאוד גם בקרב התושבים ביהודה ושומרון, ובחודשים האחרונים החל בפעילות אגרסיבית במחנות הפליטים מתוך מטרה לעצב את המציאות מחדש ביו"ש, כך שתשנה פניה אחרי המלחמה. את בלוט צפוי להחליף תא"ל יקי דולף.