עימותים פרצו הבוקר (חמישי) בין מתפרעים ערבים לבין כוחות המשטרה בהר הבית, עם תחילת כניסתם של יהודים אל ההר, לראשונה זה שבועיים. המשטרה פיזרה את המתפללים המוסלמים מההר כדי לאפשר את כניסת היהודים, ובהמשך סגרה בשרשראות ברזל את דלתות המסגד, כשבפנים מתבצרים עשרות מתפללים. בין העולים להר הבוקר ח"כ יום טוב כלפון מסיעת ימינה של ראש הממשלה נפתלי בנט. בכניסה להר הוא ספג צעקות: ''מישהו מממשלה עם חמאס, ההיסטוריה לא תשכח לך".
במסגרת העימותים עשו כוחות הביטחון שימוש באמצעים לפיזור הפגנות וברימוני הלם. המשטרה מסרה כי עשרות מפירי סדר פתחו בקריאות הסתה ויידו אבנים וחפצים אחרים לעבר הכוח בהר הבית. המתפרעים נהדפו ונכנסו למסגד, ומשם החלו להשליך חפצים "תוך גרימת נזק למסגד וחילולו", לשון הודעת המשטרה.
במסגד אל-קיבלי שבמתחם ההר התבצרו מתפרעים נוספים, ואלה זרקו כיסאות וחפצים מהמסגד לעבר כוחות הביטחון. בתמונה שפורסמה מהמסגד נראות זכוכיות מנופצות, והמתפרעים טענו כי הנזק נגרם כתוצאה משימוש באמצעים לפיזור הפגנות של כוחות הביטחון. אותם מתפרעים הציבו במסגד רמקול, וממנו בוקע קטע האיום של מנהיג חמאס בעזה, יחיא סינוואר, שאמר ביום שבת האחרון שאסור שתחזור התמונה שבה שוטרים נכנסים למסגד אל-אקצא. השוטרים עומדים בפתח המסגד ומנסים לפנות אותו. לפי שעה הם אכן לא נכנסים פנימה.
במהלך פיזור המתפרעים נחבל שוטר אחד באורח קל. המשטרה מסרה כי הביקורים נמשכים כסדרם ללא הפרעה למתפללים הנמצאים בשטח הר הבית, וכוחות הביטחון פועלים לאבטחה ושמירת הסדר באזור. במשטרה גם הדגישו כי בימים האחרונים מופצים ברשתות החברתיות פרסומים כוזבים ושקריים רבים לגבי הר הבית מתוך מטרה להתסיס את השטח ולהסית לאלימות.
"מדובר בפרסומים כוזבים חסרי כל אחיזה במציאות ופרסומם נעשה בכדי להטעות את הציבור, להסלים ולחמם את האוירה. אנו קוראים לציבור לא להישמע לפייק ניוז ולהסתה פרועה זו שמופצת ברובה ע"י גורמים עוינים ובעלי אינטרס ברשתות החברתיות", אמרו במשטרה. "יובהר כי אין כל שינוי בנוהג הקיים מזה שנים רבות בהר הבית בהקשר של תפילות או של ביקורי ישראלים ותיירים במקום. כל מי שיפר את הסדר במקומות הקדושים וינהג באלימות מכל סוג שהיא – יטופל בנחישות ובאפס סובלנות".
העימותים מגיעים יממה אחרי ההסלמה שנשמעה באיומים מצד ארגוני הטרור על רקע הכוונה לאפשר עליית יהודים להר הבית היום, יום העצמאות. במשך שבועיים אסרה ישראל על עליית יהודים להר, לאורך החלק השני של חודש הרמדאן ועיד אל-פיטר. בחמאס הגדירו את ההחלטה הישראלית "משחק באש".
הפלגים הפלסטיניים קראו לפלסטינים להגיע למסגד אל-אקצא ולהגן עליו. חמאס איים אתמול כי ישראל משחקת באש אם היא תאפשר ליהודים "לפרוץ", כדבריהם, למסגד אל-אקצא ביום העצמאות. "הדבר יוביל להסלמה שישראל תהיה אחראית לה", איימו.
גם הג'יהאד האיסלאמי הצטרף לאיומים ומסר מטעמו כי "ההתקפה על מסגד אל-אקצא מחייבת את כולנו להיות מוכנים להתמודד עם כל פגיעה בקדושתו ובמעמדו. קריאות המתנחלים לפלוש למסגד נחשבות כמלחמה נגד עמנו ומקומותינו הקדושים, ולא נהסס להגן על אל-אקצא ועל ירושלים. אנחנו מזהירים מפני ההשלכות של קריאות המתנחלים לפלוש למסגד, רואים בישראל האחראית המלאה למה שיתרחש בעקבות זאת, וקוראים להגיע לאל-אקצא ולהתעמת עם המתנחלים שמטרתם לחלק את המסגד במרחב ובזמן".
במקביל קרא הווקף לפלסטינים באמצעות המופתי של ירושלים, מוחמד חוסיין, שלא לאפשר את הנפת דגלי ישראל במתחם ההר היום. גם שלשום איימו בחמאס כי עליית יהודים להר הבית ביום העצמאות תוביל להסלמה מחודשת. דובר הארגון בעזה, עבד א-לטיף אלקאנוע, אמר כי אישור ישראלי לכך הוא בגדר נפץ שיוביל לעימות חדש. הוא קרא לפלסטינים ממזרח ירושלים לסכל זאת ולהתעמת עם ישראלים שינסו להיכנס למתחם ההר. לדבריו, הפלסטינים לא יסכימו לחזרה של "הפריצות", כלשונו, למסגד אל-אקצא ולחלוקתו לזמנים ומקומות.