ראש הממשלה בנימין נתניהו השווה בין מו"מ עם ההסתדרות לבין המגעים לעסקה מול חמאס? אחרי שלשכתו הכחישה את הדיווחים על כך, התייחס לכך היום (ד') יו"ר אגף ההסברה בהסתדרות, יניב לוי, ואמר בריאיון ל־ynet: "אני מכבד את ראש הממשלה וגם את הפרסום. זו הייתה פליטת פה אומללה וטוב שהוא הבהיר את הדברים. הגיעה העת אחרי 10 וחצי חודשי מלחמה שיתחילו לדבר בשיח מאחד, לא להשוות בין ארגון עובדים לארגון טרור".
לדברי לוי, "כשאתה אומר שאם ניהלתי מו"מ, כל בר דעת יכול להבין את ההקשר. מקווה שבלשכת רה"מ יסכימו להבין שאין מה להשוות בינינו לארגון טרור. יש כאן הסתה, אבל אנחנו לא מצפים להתנצלות נוספת. הכי חשוב לנו שהוא יטפל במשימה הכי חשובה - החזרת החטופים. אנחנו נמצאים בקשר הדוק יומיומי עם המשפחות, עם המטה. גם מבחינה כספית וגם מורלית. הלוואי שהמפתחות היו בידיים שלנו, אם ארנון היה מוביל את המו"מ - אולי זה היה נראה אחרת".
לפי דיווח בחדשות רשת אמש (שלישי) הוא טען לאחרונה בדיונים סגורים: "אני יודע היטב לנהל משא ומתן. ניהלתי מו"מ מול ההסתדרות". לפי הדיווח, בכירים במערכת הביטחון התרעמו וענו כי "מול ההסתדרות אולי יש לך זמן לנהל מו"מ - כאן אין זמן. כל יום חטופים יכולים למות".
בהמשך פרסמה לשכת ראש הממשלה הכחשה לדיווח: "ראש הממשלה נתניהו לא הקביל את המשא ומתן שעשה עם ההסתדרות למשא ומתן עם החמאס. ההיפך המוחלט - הוא הנגיד בין הדברים. ראש הממשלה טען בבירור כי להבדיל ממשא ומתן עם ההסתדרות - שבו הנושא הוא תקציבי - המשא ומתן לעסקת החטופים הוא עניין של חיים ומוות. דווקא בשל כך, ראש הממשלה נתניהו מתעקש על מקסום מספר החטופים החיים שישוחררו כבר בשלב הראשון של המתווה".
בשבועות האחרונים נרשם עימות בין ארגון העובדים לבין לשכת רה"מ על רקע הכוונה של נתניהו למנות את נציב שירות המדינה הבא. ההסתדרות עתרה לבג"ץ נגד הכוונה, ובעתירה היא טוענת כי מינוי נציב שירות המדינה בידי ראש הממשלה יוביל לפוליטיזציה של המשרה ולהגברת התופעה של מינויים פוליטיים. לטענת העותרים, מדובר בפגיעה אנושה בשירות המדינה ובעובדי המגזר הציבורי - שילמדו מההחלטה כי קיימת עדיפות ברורה לקשרים פוליטיים על פני כישורים מקצועיים.