במערכת הביטחון הביעו דאגה בימים האחרונים מהטיפול בחומרים מסווגים במהלך המלחמה.
מתחילת הלחימה נאספו אלפי מסמכים ברצועת עזה, חלקם ברמת סיווג גבוהה, על-ידי הכוחות המתמרנים. המסמכים הועברו לטיפול באגף המודיעין ובמערכת הביטחון, ותרמו למודיעין שהופק במהלך הלחימה. החומרים נחקרים על-פי סוגם ובשותפות גופי איסוף ומחקר שונים בקהיליית המודיעין.
רק בחודש שעבר, נזכיר, חשף רונן ברגמן ב"ידיעות אחרונות" ו-ynet כי צה"ל פתח בחקירה במהלך הלחימה על מסמכים שהודלפו באופן מגמתי לתקשורת זרה.
מטרת החקירה הפנימית בצה"ל, שנפתחה לבקשת אגף המודיעין, היא לנסות לברר מי עושה שימוש מניפולטיבי במסמכי שלל מסווגים של חמאס שנתפסו בעזה – או בכאלה שרק לכאורה נלקחו מחמאס - ומעביר אותם לתקשורת הבינלאומית כדי לנסות ולהשפיע על דעת הקהל בישראל בנושא עסקת החטופים. הפרשה גרמה לכעס רב במערכת הביטחון, ומעצימה את המתח בינה לבין ראש הממשלה בנימין נתניהו.