שעות לאחר בריחתם של ששת המחבלים מכלא גלבוע השמור, הסביר הבוקר (שני) מפקד מחוז הצפון אריק יעקב כי הפיר שדרכו יצאו האסירים הוא ככל הנראה חלל במבנה בית הסוהר, כחלק מהיסודות שעליו נבנה. יעקב ציין כי "האירוע עדיין מתוחקר ועדיין נלמד. לא מדובר בדיוק במנהרה שנחפרה, יש פה כשל של המבנה שנמצא על בסיס כלונסאות. יש חלל מלמטה - וכנראה שהאסירים ניצלו זאת".
"אני לא מהנדס, בוודאי לא מהנדס לבתי כלא, אבל מתברר שבית הכלא הזה בנוי על כלונסאות. הוא נבנה ב-2004 אחרי האינתיפאדה בצורה מהירה, ומתברר שהוא בנוי כולו על כלונסאות ויש חללי אוויר בין המשטחים לכל אורך בית הכלא", אמר השר לביטחון הפנים עמר בר-לב שהגיע למקום. בר-לב ציין כי מדובר באירוע מתוכנן ומדויק - וסביר להניח שהמחבלים נעזרו בגורמים מבחוץ. "אין ספק שזו טעות. אירוע קשה שאסור שיקרה. את כל הלקחים האלה אנחנו נבדוק ונשקף לציבור בצורה ברורה", אמר.
למרות שחקלאים מאזור טמרה דיווחו על דמויות חשודות ליד הכלא ב-01:50, מפקד המחוז יעקב אמר כי האירוע, מבחינת שב"ס, החל בסביבות 03:00. "קיבלנו דיווח ממשטרת ישראל על אזרח שזיהה כמה דמויות רצות בשדות, צמוד לחומות הכלא. הפעלנו מצב חירום וביצענו ספירות שבמהלכן זיהינו פיר באחד התאים, כנראה שדרכו נמלטו האסירים".
מפקד המחוז הוסיף כי בשלב זה הוקפצו כל כוחות הסיוע כדי לאתר את האסירים, והדגיש כי נכון לעכשיו המאמץ מתרכז בחיפושים המודיעיניים ובפעילות המבצעית בשיתוף השב"כ. הוא אמר כי תרחיש של בריחה מהכלא הוא תרחיש אפשרי שבשב"ס לומדים ועובדים לאורך השנים כדי שלא יתממש. "כמובן שיש לנו מה לתחקר וללמוד כדי שאירוע כזה לא יקרה שוב", ציין.
יעקב נשאל איך ייתכן שמגדל הפיקוח לא הבחין בששת האסירים, והשיב כי הנושא יתוחקר ויילמד בשלב מתקדם יותר - וכך גם ייבחנו האמצעים הקיימים ברשות שב"ס לפיקוח על האסירים. בינתיים, 80 האסירים הביטחוניים שמרצים את מאסרם בכלא גלבוע פוזרו במתקנים ברחבי הארץ כדי ששב"ס יוכל לבחון את התאים.
שר הביטחון בני גנץ שערך ישיבה עם ראש השב"כ נדב ארגמן, ראש אגף המבצעים עודד בסיוק ומפקד פיקוד מרכז יהודה פוקס הורה על תגבור הכוחות במעברי הגבול ובקו התפר, והנחה להתכונן לתפיסת המחבלים בשיתוף פעולה של כלל גופי הביטחון.