ראש הממשלה בנימין נתניהו התייחס לעלייתו של השר לביטחון לאומי איתמר בן גביר להר הבית, ולדבריו שלפיהם המתפללים שהשתחוו במקום עשו זאת "בהתאם למדיניות", ומסר כי "קביעת המדיניות בהר הבית כפופה ישירות לממשלה ולעומד בראשה". מלשכת רה"מ נמסר כי "אין מדיניות פרטית של שר כלשהו בהר הבית - לא של השר לביטחון לאומי ולא של שום שר אחר. כך היה תמיד בכל ממשלות ישראל. האירוע הבוקר הוא חריגה מהסטטוס-קוו. המדיניות של ישראל לא השתנתה - כך היה וכך יהיה". בן גביר מסר בתגובה: "המדיניות שלי היא לאפשר חופש פולחן ליהודים בכל מקום, ויהודים ימשיכו לעשות זאת גם בעתיד. הר הבית הוא שטח ריבוני בבירתה ישראל, ואין חוק המתיר לנהוג באפלייה גזענית נגד יהודים".