בלשכתו של ראש הממשלה בנימין נתניהו התייחסו לפרשת הדלפת המסמכים הסודיים, והכחישו את מעורבותו: "המסמך שפורסם כלל לא הגיע ללשכה מאמ"ן, ונתניהו למד עליו מהתקשורת. האדם המדובר מעולם לא השתתף בדיונים ביטחוניים, לא נחשף או קיבל מידע מסווג, ולא לקח חלק בביקורים סודיים". כמו כן, נמסר כי "מתחילת המלחמה אנו עדים לשיטפון של הדלפות מגמתיות ופליליות מישיבות סודיות. תמוה מאוד מדוע מכל ההדלפות, דווקא מסמך זה - שתוכנו היה ידוע לכל וסייע למדינת ישראל, זכה לחקירה כה אגרסיבית ומגמתית".