כוחות הביטחון מנהלים משעות הבוקר (יום רביעי) מצוד אחר המחבלים שביצעו את הפיגוע הכפול בירושלים, וכוחות רבים ערוכים לכל התרחשות במרחב ירושלים וג'נין. לפי שעה, המאמצים מתמקדים במישור המודיעיני, ובזמן שמאות שוטרים פרוסים בשטח - אלפי שוטרים נמצאים בכוננות שיא. בפיגוע נרצח אריה שצ'ופק בן ה-16, ונפצע באורח אנוש טדסה בן מאדה, גבר בשנות ה-40 לחייו.
בתום הערכת מצב ביטחונית שקיים בקריה, ראש הממשלה יאיר לפיד שלח את תנחומיו למשפחתו של הנרצח בפיגוע. "נער שלא עשה דבר רע לאף אדם בעולם ונרצח רק מפני שהוא יהודי. אני שולח איחולי החלמה ורפואה שלמה לפצועים", אמר לפיד. "זה אירוע שונה באופיו ממה שראינו בשנים האחרונות. מתנהל כעת מאמץ מודיעיני נרחב שיביא לגילוי המחבלים הנתעבים, לגילוי מי שעומד מאחוריהם ומי שמספק להם אמצעי לחימה".
"אני רוצה לומר מפה לאזרחי ישראל - אנחנו נגיע אליהם", המשיך לפיד. "הם יכולים לברוח, הם יכולים להסתתר, זה לא יעזור להם. כוחות הביטחון יגיעו אליהם. אם הם יתנגדו - הם יסוכלו. אם לא, אנחנו נמצה איתם את מלוא חומרת הדין. בהערכת המצב היום הורינו לעבות את הכוחות במרחב ירושלים בימים הקרובים, ולהגביר את הסריקות בכל הגזרות הרלוונטיות. צה"ל, שב"כ והמשטרה פרוסים בשטח בשעות אלה כדי לוודא שלא יהיו פיגועי המשך".
לפיד התייחס גם לחטיפתו של טירן פרו, שנפצע באורח אנוש בתאונת דרכים בג'נין ונחטף על ידי חמושים פלסטינים מבית החולים. "שוחחתי היום עם אביו של טירן. לפי עדות המשפחה החוטפים נכנסו לבית החולים, ניתקו מהמכשירים ילד שנאבק על חייו וחטפו את גופתו. ישראל הוכיחה בחודשים האחרונים שאין מקום ואין מחבל שהיא לא יודעת להגיע אליו - מהקסבה בשכם, מחנה הפליטים בג'נין, זירות קרובות ורחוקות. אם גופתו של טירן לא תוחזר, החוטפים ישלמו מחיר יקר. מדינת ישראל מתמודדת עם הטרור מיום הקמתה. אויבינו צריכים לדעת שאנחנו עומדים מולם מאוחדים וחזקים, עם אחד שיודע להתייצב יחד אל מול מבקשי נפשנו".
לפי הערכות ראשוניות במערכת הביטחון, לפיגוע בירושלים אחראים כמה מחבלים יחד. לפי החשד, המחבלים פעלו ללא הכוונה חיצונית או מלמעלה של ארגוני טרור, ותכננו את הפיגוע זמן רב. החשד הראשוני הוא שהחוליה הכירה היטב את האזור שבו בוצעו הפיגועים. המחבלים, לפי החשד, וידאו קודם שיש כמה שיותר אזרחים בתחנת האוטובוס - ואז הפעילו את מטען החבלה בזירה הראשונה בכניסה לירושלים מרחוק.
ההערכות הן שמטעני החבלה היו קטנים יחסית, כשרוב הפגיעות נבעו ממסמרים ומרסס שהתפזרו למרחק קצר ופגעו באנשים שעמדו בסמוך. לאחר מכן התפוצץ מטען חבלה נוסף בצומת רמות באופן דומה.
ההערכה היא שהרקע למעשה הוא סוגיית הר הבית וירושלים, ללא קשר לחטיפת הצעיר שנהרג בתאונת דרכים בג'נין וגופתו מוחזקת כעת בידי חמושים, למהומות בחברון בשבת או לחילופי האש בשכם שלשום במהלך כניסת מאות מתפללים יהודים לקבר יוסף. ככל הנראה לא הייתה התרעה ממוקדת לפיגוע הבוקר, אלא הערכות כלליות על דרך פעולה אפשרית לפגוע בתקופה זו גם באמצעות מטעני חבלה.
ארצות הברית גינתה את הפיגוע שאירע הבוקר בירושלים. "ארה"ב הציעה סיוע לממשלת ישראל בזמן שהיא חוקרת את הפיגוע ופועלת כדי לתפוס את המפגעים", נמסר מהבית הלבן. "אנו שולחים את תנחומינו למשפחת הנרצח ומאחלים החלמה מהירה לפצועים. ארה"ב עומדת לצד ממשלת ישראל ואזרחיה. כפי שהדגיש הנשיא ביידן במהלך ביקורו בישראל ביולי האחרון, המחויבות שלנו לביטחונה של ישראל איתנה ובלתי ניתנת לשבירה". שגריר ארה"ב בישראל טום ניידס כתב בטוויטר: "אני נחרד מפיגועי הטרור הפחדניים בירושלים שכוונו כלפי אזרחים חפים מפשע, כולל ילדים. ליבי עם משפחות הנפגעים".
מהמרכז הרפואי הדסה נמסר כי טיפלו לאורך היום ב-24 נפגעים כתוצאה מהפיגועים, בהם גם נפגעי פציעות חודרות, גם נפגעים מרסיסים וגם נפגעי חרדה. "מתוך עשרה נפגעים שפונו להדסה הר הצופים, נותרו כעת שניים מטופלים במיון", נמסר. "השאר שוחררו לאחר קבלת טיפול. הפצוע במצב בינוני שנפגע בפיגוע הראשון בכניסה לעיר הועבר להדסה עין כרם ונמצא בשעה זו בחדר ניתוח".
"מתוך 14 נפגעים שפונו להדסה עין כרם, מטופלים כעת שלושה פצועים במיון והשאר שוחררו לאחר הטיפול לביתם", נמסר עוד. נכון לשעות הצהריים נמצאים בבית החולים שישה פצועים, מתוכם אחד בחדר הניתוח.
לשערי צדק הגיעו בסך הכול 15 פצועים, מהם תשעה נפגעי חרדה. מותו של אחד הפצועים, שצ'ופק, נקבע במקום - והרופאים נאבקים כעת על חייו של טדסה, שנמצא לפי בית החולים בסכנת חיים מיידית. "הוא סובל מפגיעת ראש קשה מאוד", מסר ד"ר אלון שורץ, מנהל יחידת הטראומה. המשפחה ביקשה להתפלל לרפואת טדסה בן מאדה.